Добрый день!
На Ваш вопрос достаточно подробно ответил Закревский К.Е. в своей книге по геологическому моделированию. Скачайте книгу
http://petroportal.ru/uploads/library/35_88ad04448c96fe5eb841f8b6ab298872.pdf у нас на сайте в Библиотеке "Геологическое моделирование 3D". В главах 5 и 6 подробно рассказывается об алгоритмах построения кубов литофаций и ФЕС.
Для понимания работы окон предлагаю посмотреть "Практикум по геологическому моделированию в Petrel 2013. 2017 г." из раздела Библиотека - Курсы, Главы 3 и 4.
Если у Вас останутся вопросы, пишите.