Если я правильно понял вопрос, то Вам нужно в одной зоне задать два уровня ВНК для дальнейшего моделирования. В таком случае Вам нужно создать одну поверхность с нужными контактами ВодаНефть в соответствующих полигонах. Более детально посмотрите Практикум по геологическому моделированию в нашей Библиотеке, глава о ВНК.